List of phylogenetic (barcode) markers used in oligonucleotide barcoding and similarity search.
Total Species: 101
| Total sequences: 686 | 123 | 180 | 141 | 118 | 124 |
| Species (total: 101) | ITS1 and 2 | tef1_int4(large) | tef1_int5(short) | tef1_exon6(large) | rpb2_exon |
|---|---|---|---|---|---|
01harz H. lixii/T. harzianum |
21 | 26 | 6 | 3 | 2 |
| 02cer T. cerinum |
1 | 5 | 1 | 1 | |
| 02tom T. tomentosum |
1 | 9 | 2 | 1 | 1 |
| 03cinn H. cinnamomea/T. cinnamomeum | 1 | 1 | 1 | 3 | 5 |
| 04stram H. straminea/T. stramineum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 05vel T. velutinum | 1 | 4 | 2 | ||
| 06atrog H. atrogelatinosa | 1 | 1 | 1 | ||
| 07cat H. catoptron/T. catoptron | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 09cfaur T. sp. DAOM 175924 |
2 | 3 | 1 | ||
| 100kons T. koningiopsis | 2 | 4 | 1 | ||
| 10aggrA T. aggressivum f. aggressivum | 1 | 5 | 1 | 1 | 1 |
| 10aggrE T. aggressivum f. europaeum | 1 | 2 | 1 | ||
| 11tawa H. tawa/T. tawa | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 |
| 12thail H. thailandica/T. thailandicum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 13cras H. crassa/T. crassum |
1 | 1 | 2 | 2 | 3 |
| 13long T. longipile |
1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 14vir H. virens/T. virens | 1 | 2 | 4 | 1 | |
| 15hun H. hunua | 1 | 1 | 2 | 1 | |
| 15sem H. semiorbis | 2 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 17fert T. fertile | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 |
| 18obl T. oblongisporum | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| 19aurM H. aureoviridis var. macrospora |
1 | 1 | 1 | 1 | |
| 20stri H. strictipilosa/T. strictipilis |
1 | 1 | 1 | 19 | 27 |
| 22cun H. cuneispora | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 23_3559 T. sp. PPRI 3559 |
1 | 1 | 2 | ||
| 24ross T. rossicum | 1 | 3 | 6 | ||
| 25strom T. stromaticum | 2 | 1 | 1 | 1 | |
| 26brev T. brevicompactum | 1 | 7 | 2 | 1 | 1 |
| 27lut H. lutea |
1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 27melano H. melanomagna |
1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 29est H. estonica/T. estonicum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 30ceram H. ceramica/T. ceramicum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 31surr H. surrotunda/T. surrotundum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 32sinu H. sinuosa/T. sinuosum |
1 | 1 | 1 | 12 | 16 |
| 33crem H. cremea/T. cremeum |
1 | 1 | 1 | 2 | 2 |
| 34chlo H. chlorospora/T. chlorosporum | 1 | 1 | 1 | 3 | 5 |
| 35viresc H. virescentiflava | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 36cand H. candida/T. candidum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 37cost H. costaricensis | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 38thele H. thelephoricola/T. thelephoricolum | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 39aure H. aureoviridis/T. aureoviride | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 |
| 40pilu H. pilulifera/T. piluliferum | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| 41lacu H. lacuwombatensis | 1 | 1 | 1 | ||
| 42stel H. stellata | 1 | 1 | 1 | ||
| 43parap H. parapilulifera | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 44poly H. pachybasioides/T. polysporum | 2 | 1 | 12 | 1 | 1 |
| 45minu H. minutispora/T. minutisporum | 1 | 1 | 9 | 1 | 1 |
| 46citr H. citrina var. citrina | 1 | 1 | 2 | 1 | 1 |
| 47sulph H. sulphurea | 1 | 1 | |||
| 48psy H. psychrophila | 1 | 1 | 1 | ||
| 50pulv H. pulvinata | 1 | 1 | 1 | ||
| 52hel T. helicum | 2 | 3 | 4 | 1 | 2 |
| 53spir T. spirale | 1 | 2 | 3 | 2 | 1 |
| 54gela H. gelatinosa/T. gelatinosum | 1 | 1 | 2 | 3 | 3 |
| 55sulw H. sulawesensis | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 56nigrov H. nigrovirens | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| 57chrom H. chromosperma/T. chromospermum | 1 | 1 | 1 | 8 | 8 |
| 58phyll H. phyllostachydis/T. phyllostahydis | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 |
| 59kon T. koningii |
1 | 2 | 2 | ||
| 59oval T. ovalisporum |
1 | 1 | |||
| 60muri H. muroiana |
1 | ||||
| 62vir H. rufa/T. viride |
1 | 7 | 1 | 3 | 1 |
| 63atro H. atroviridis/T. atroviride | 1 | 5 | 2 | ||
| 64erin T. erinaceum | 1 | 1 | 4 | ||
| 65strig T. strigosum | 1 | 2 | 1 | 1 | 1 |
| 66stil H. stilbohypoxyli | 1 | 3 | |||
| 67ham T. hamatum | 1 | 2 | 2 | 1 | 1 |
| 68pub T. pubescens | 2 | 2 | 1 | 1 | |
| 69asper T. asperellum | 1 | 2 | 1 | ||
| 70flav H. flaviconidia | 1 | 3 | 1 | ||
| 71neor H. neorufa | 1 | 2 | |||
| 72pez H. pezizoides | 1 | 1 | 1 | ||
| 73andi H. andinensis | 1 | 1 | 1 | ||
| 74cereb H. cerebriformis |
|||||
| 74longib T. longibrachiatum |
1 | 1 | 1 | 1 | |
| 74orient H. orientalis |
1 | 2 | 2 | 1 | |
| 76citri H. schweinitzii/T. citrinoviride | 1 | 1 | 1 | 1 | |
| 77pseud H. pseudokoningii/T. pseudokoningii | 1 | 1 | 1 | ||
| 78ghane T. ghanense | 1 | 1 | 1 | ||
| 79satur T. saturnisporum | 1 | 1 | 1 | 1 | |
| 80sin T. sinensis | 1 | 2 | 4 | ||
| 81jecor H. jecorina/T. reesei | 1 | 1 | 1 | 1 | |
| 82effu T. effusum | 1 | 1 | 1 | ||
| 83nov H. novaezelandiae | 1 | 1 | 1 | ||
| 84konil T. konilangbra | 1 | 1 | |||
| 86poron H. poronioidea | |||||
| 88_3642 T. sp. MA 3642 |
1 | 1 | |||
| 91avel H. avellanea | |||||
| 92rog T. rogersonii | 1 | 1 | |||
| 93aust T. austrokoningii | 3 | ||||
| 94intr T. intricatum | 1 | 2 | |||
| 95taiw T. taiwanense | 1 | 1 | |||
| 96dorot T. dorotheae | 1 | 1 | |||
| 97ding T. dingleyaea | 1 | 1 | |||
| 98peter T. petersenii | 1 | 3 | |||
| 99a_caribbae T. caribbaeum var. aequatoriale | 1 | 1 | |||
| 99carib T. caribbaeum | 1 | 2 | |||
| cryst H. crystalligena | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
| pauci T. paucisporum | 1 | 1 | 1 | ||
| theob T. theobromicola | 1 | 1 | 1 | ||
| vogl H. voglmayrii | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
